土壤生物与生态研究部以土壤生物学、生物化学和土壤生态学理论为基础，重点开展土壤生物多样性，土壤物质循环过程，土壤生态系统演变与稳定机制，微生物资源发掘与土壤健康调控，面源污染防控及全球变化应对等方面的研究。

部门负责人、学术带头人与青年骨干：

部  长：褚海燕 研究员 土壤微生物生态学

副部长：朱春梧 研究员   作物生理对全球变化的响应及利用

        胡君利 副研究员 土壤微生物功能与调控、菌根生物学

颜晓元 研究员   陆地生态系统碳氮循环及其农业与环境效应

徐  华 研究员   农田温室气体排放

贾仲君 研究员   土壤微生物生态与进化

吴永红 研究员   元素生物地球化学循环、农业面源污染控制、水土保持与生态修复等理论与技术

王慎强 研究员   农田生态系统氮磷循环与农业环境

赵  旭 研究员   农田氮素循环与环境效应

刘  勤 研究员   农田生态系统养分循环与环境效应

王  辉 研究员   退化土壤生态学

夏永秋 研究员   氮素循环及其环境效应、农业面源污染模拟与阻控

单  军 研究员   土壤碳氮生物地球化学过程及其环境效应

夏龙龙 研究员   土壤碳氮生物地球化学循环与全球气候变化

马  静 副研究员 农田温室气体排放机理及减排对策

张广斌 副研究员 农田生态系统碳氮循环

刘俊琢 副研究员 藻-菌生物膜与污染物界面反应、土-水界面生物电化学

李建刚 副研究员 土传病害营养生态调控与土壤健康恢复

汪  玉 副研究员 农田磷素行为及环境效应

申亚珍 副研究员 新型肥料的研制与应用评价

遆超普 副研究员 氮循环及其环境效应

唐  骏 副研究员 农田纳米材料生态效应、新兴面源污染防控

蔡元锋 副研究员 甲烷氧化的生理生态过程及其微生物机制

孙朋飞 副研究员 稻田周丛生物与养分循环　

杨  腾 副研究员 真菌多样性及其生物地理分布

高贵锋 副研究员 土壤微生物生物地理与群系演变

蔡思源 副研究员 农田土壤碳氮循环、区域农业管理决策